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Enregistrement W4412641270 · doi:10.1111/mec.70029

Multiple Origins of Sex Chromosomes in <i>Nothobranchius</i> Killifishes

2025· article· en· W4412641270 sur OpenAlexfundno aff
Monika Hospodářská, Pablo Mora, Anna Voleníková, Ahmed Al‐Rikabi, Marie Altmanová, Sergey A. Simanovsky, Nikolas Tolar, Tomáš Pavlica, Karolína Janečková, Jana Štundlová, Kseniya Bobryshava, Marek Jankásek, Matyáš Hiřman, Thomas Liehr, Martin Reichard, E. Yu. Krysanov, Petr Ráb, Christoph Englert, Petr Nguyen, Alexandr Sember

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidad de JaénAustralian GovernmentUniversité de MonctonLeibniz-GemeinschaftAkademie Věd České RepublikyMinisterstvo Školství, Mládeže a TělovýchovyEuropean CommissionGrantová Agentura České RepublikyUniverzita Karlova v Praze
Mots-clésBiologyEvolutionary biologyY chromosomeLineage (genetic)Locus (genetics)CladeX chromosomeVertebrateGeneticsGenePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Sex chromosomes have evolved repeatedly across eukaryotes. The emergence of a sex‐determining (SD) locus is expected to progressively restrict recombination, driving convergent molecular differentiation. However, evidence from taxa like teleost fishes, representing over half of vertebrate species with unmatched diversity in SD systems, challenges this model. Teleost sex chromosomes are often difficult to detect as they experience frequent turnovers, resetting the differentiation process. Nothobranchius killifishes, which include the XY system shared by N. furzeri and N. kadleci and X 1 X 2 Y systems in six other species, offer a valuable model to study sex chromosome turnovers. We characterised X 1 X 2 Y systems in five killifish species and found that sex chromosomes evolved at least four times independently. Sex‐determining regions resided near centromeres or predicted chromosome rearrangement breakpoints in N. brieni and N. guentheri , suggesting recombination cold spots may facilitate sex chromosome evolution. Chromosomes representing the XY system in N. furzeri / N. kadleci were sex‐linked also in the outgroup Fundulosoma thierryi , with several genes, including gdf6 , residing in the region of differentiation. Although the X 1 X 2 Y systems of N. guentheri , N. lourensi (both Coastal clade), and N. brieni (Kalahari clade) involved different chromosomes, they shared a potential SD region. We uncovered two sex‐linked evolutionary strata of distinct age in N. guentheri . However, its potential SD gene amhr2 was located in the younger stratum and is hence unlikely to be the ancestral SD gene in this lineage. Our findings suggest recombination landscapes shape sex chromosome turnover and that certain synteny blocks are repeatedly co‐opted as sex chromosomes in killifishes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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