Contribution of reversible histone acetylation to freeze tolerance and recovery in wood frog kidneys
Notice bibliographique
Résumé
The wood frog (Rana sylvatica) possesses remarkable adaptation mechanisms that ensures it survival in extreme environmental conditions, including enduring whole body freezing. The present study investigates the epigenetic mechanisms, specifically histone lysine acetylation and deacetylation, which are critical for regulating gene expression and conserving energy, underlying the wood frog's ability to endure whole-body freezing. We investigated the expression patterns of lysine acetyltransferases (KATs) and lysine deacetylases (HDACs) in wood frog kidney over the freeze-thaw cycle. Our results reveal a significant downregulation of KATs in kidneys of frozen frogs, with specific KATs showing considerable reductions. This suggests that histone acetylation may play a vital role in suppressing gene expression and conserving energy during freezing. Furthermore, histone acetylation marks, including H2AK5ac, H2BK5ac, H3K9ac, H3K23ac, H3K27ac, and H3K56ac, showed repression under frozen and thawed conditions, indicating a role in silencing specific genes. HDACs exhibited dynamic regulation, with HDAC3 and HDAC11 showing significant repression in frozen frog kidneys, while HDAC5, p-HDAC4, and p-HDAC8 were downregulated during the recovery phase, suggesting their involvement in the thawing process. This research provides crucial insights into the epigenetic control of freeze tolerance in wood frog kidneys and offers a foundation for further exploration of epigenetic modifications that mediate the wood frog's remarkable adaptations for freezing survival.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».