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Enregistrement W4412653397 · doi:10.1002/jcph.70084

Four Pharmacogenomic Variants Strongly Linked to Corticosteroid‐Induced Avascular Necrosis in Children with Cancer

2025· article· en· W4412653397 sur OpenAlexafffund
Miguel Córdova‐Delgado, Erika N. Scott, Shahrad R. Rassekh, Catrina M. Loucks, Wan‐Chun Chang, Edward J. Raack, Jessica N. Trueman, Colin J.D. Ross, Bruce Carleton

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Pharmacology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Joint Diseases
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesHealth CanadaGenome British ColumbiaProvincial Health Services AuthorityBC Children's HospitalCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésPharmacogenomicsAvascular necrosisCorticosteroidMedicineCancerOncologyPharmacogeneticsNecrosisInternal medicinePharmacologyBioinformaticsBiologySurgeryGeneticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Corticosteroids are effective anti‐cancer agents for treating hematologic malignancies in children. However, avascular necrosis (AVN) is a common and debilitating adverse effect, leading to bone death and impacting long‐term quality of life. This study aimed to uncover the genetic factors contributing to corticosteroid‐induced AVN in a well‐characterized cohort of pediatric cancer patients. We conducted a genome‐wide association study (GWAS) on 972 patients, including 108 with AVN grade ≥2 and 864 dose‐matched controls. The GWAS of 6.4 million genetic markers identified four significant AVN‐associated loci ( P < 5 × 10 −8 ): WNT7B (OR = 9.2; 95% CI, 3.8‐22.0), POGK (OR = 8.4; 95% CI, 3.6‐19.5), ZNF37A (OR = 6.0; 95% CI, 2.9‐12.5), and a synonymous variant in FAM240C (OR = 5.0; 95% CI, 2.6‐9.5). A multi‐marker predictive model combining single nucleotide polymorphisms (SNPs) and clinical factors showed an area under the ROC curve (AUC) of 78.7%, outperforming SNP‐only (67.8%) and clinical‐only (68.4%) models. The osteogenic processes regulated by WNT7B , part of the Wnt signaling pathway, may contribute to AVN‐related disrupted bone development and repair. Similarly, POGK and ZNF37A , both containing the KRAB domain, are hypothesized to affect osteoblast differentiation and skeletal development in AVN. Developing a predictive model for individual susceptibility to corticosteroid‐induced AVN will enhance the monitoring and management of corticosteroid use in children with cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,360 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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