<i>Acinetobacter baumannii</i> : much more than a human pathogen
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Acinetobacter baumannii is a major human nosocomial pathogen. Due to this, a significant amount of knowledge has been gained about human clinical isolates over a substantial period of time. More recently, studies have begun to pay attention to non-human isolates of A. baumannii . In reviewing these studies, we highlight some major trends. First, A. baumannii has been found in a variety of sources/hosts: from diverse types of animals, to food products, to plants and even aquatic environments. Second, considering the molecular epidemiology of A. baumannii , two scenarios are possible. One implies transmission between human and non-human populations, and this has been described in several international clones (ICs): IC1, IC2, IC5, IC7, and IC8. In the other scenario, human populations are well differentiated from non-human populations, and there is no exchange between them. Third, in terms of antibiotic resistance in the non-human populations, these populations tend to have fewer antibiotic resistance genes, mostly intrinsic in nature. However, when non-clinical bacterial populations come into closer contact with humans, the antibiotic resistance profiles of the non-human bacterial population become more similar to those of clinical populations. Also, there are some instances of non-human isolates showing extensive drug resistance phenotypes. By far, the least studied aspect is the virulence potential of A. baumannii from non-human sources. A small number of studies suggest that some non-human isolates can be as virulent as the human isolates. Finally, we discuss gaps in knowledge and future research avenues when considering non-human populations of A. baumannii and their relationship with human populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».