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Enregistrement W4412653831 · doi:10.1002/chem.202501987

Chemical Synthesis and Structural Determination of the Inositol Glycan Head of Plant Sphingolipid GIPC in Brassicaceae

2025· article· en· W4412653831 sur OpenAlexfundno aff
Yutaka Umemura, M. Saidul Islam, Rumana Yesmin Hasi, Toshiki Ishikawa, Minoru Nagano, Takuji Oka, Naoko Komura, Akihiro Imamura, Hideharu Ishida, Hiromune Ando, Tamotsu Tanaka

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyCanadian Glycomics NetworkJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologySupport for Pioneering Research Initiated by the Next Generation
Mots-clésBrassicaceaeSphingolipidGlycanChemistryBotanyInositolBiologyBiochemistryGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycosylinositol phosphoceramides (GIPCs), a major class of plant sphingolipids, are key components of the plasma membrane and play important roles in plants. These molecules consist of a ceramide 1-phosphate tail attached to an inositol glycan (IG) head, which typically contains an d-glucuronic acid (GlcA)-α(1→2)-myo-inositol structure. The second monosaccharide linked to the O-4 position of the GlcA residue differs depending on plant species and cell tissues. In Arabidopsis, the predominant second monosaccharide has been identified as hexose (Hex) using LC-MS/MS analysis. However, the stereochemistry and anomeric configuration of the Hex have not yet been determined using spectroscopic techniques. In this study, we chemically synthesized three different Hex-type IGs in which the GlcA residue binds to d-glucose, d-galactose, or d-mannose (Man) as the second monosaccharide. Using the synthetic standards, we determined the IG head structure of naturally occurring GIPCs isolated from cabbage by using several analytical methods. We successfully confirmed that Hex as the second monosaccharide linked to the GlcA residue is d-Man with an α-glycosidic bond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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