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Enregistrement W4412654258 · doi:10.1099/jgv.0.002115

Summary of taxonomy changes ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) from the Fungal and Protist Viruses Subcommittee, 2025

2025· article· en· W4412654258 sur OpenAlexaff
Sead Sabanadzovic, Chantal Abergel, Marı́a A. Ayllón, Leticia Botella, Marta Canuti, Yuto Chiba, Jean‐Michel Claverie, R. H. A. Coutts, Stefania Daghino, Livia Donaire, Marco Forgia, Ondřej Hejna, Jichun Jia, Dàohóng Jiāng, Ioly Kotta‐Loizou, Mart Krupovìč, Andrew S. Lang, Matthieu Legendre, Shin-Yi Lee Marzano, Luca Nerva, Judit J. Pénzes, Anna Poimala, Sofia Rigou, Yukiyo Sato, Wajeeha Shamsi, Nobuhiro Suzuki, Massimo Turina, Syun‐ichi Urayama, Eeva J. Vainio, Jiǎtāo Xiè

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésBiologyMycovirusVirologyTaxonomy (biology)ProtistPlant virusVirus classificationTaxonGenomeVirusRNAGeneticsZoologyEcologyRNA polymeraseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Fungal and Protist Viruses Subcommittee (SC) of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) has received a total of eight taxonomic proposals for the 2024 annual cycle. The extent of proposed changes varied, including nomenclatural updates, creation of new taxa and reorganization of established taxa. Following the ICTV procedures, all proposals were reviewed and voted upon by the members of the Executive Committee with ratification in March 2025. As a result, a total of 52 species in the families Botourmiaviridae and Marnaviridae were renamed to comply with the mandated binomial format. A new genus has been added to the dsRNA virus family Amalgaviridae, while two new families, Splipalmiviridae (Wolframvirales) and Mycoalphaviridae (Hepelivirales), were created to classify new groups of positive-sense (+) RNA mycoviruses. The class Arfiviricetes (Cressdnaviricota) was expanded by a new order Lineavirales and a new family Oomyviridae of ssDNA viruses. Additionally, a new class Orpoviricetes was created in the kingdom Orthornavirae to classify a group of bisegmented (+)RNA viruses reported from fungi and oomycetes. Finally, the order Pimascovirales was reorganized to better depict evolutionary relationships of pithoviruses and related viruses with large dsDNA genomes. The summary of updates in the taxonomy of fungal and protist viruses presented here is limited to taxa within the remit of this Subcommittee. For information on taxonomy changes on other fungal viruses closely related to animal and/or plant viruses, please see reports from sister ICTV Subcommittees (i.e. Plant Virus SC and Animal dsRNA and ssRNA(−) Viruses SC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,023
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,038
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,121

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0230,038
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0100,009
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0080,004
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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