An investigation of the microbiological quality of smoked fish in England and detection of <i>Listeria monocytogenes</i> strains associated with listeriosis
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: A survey to determine the presence of Listeria and indicator bacteria in smoked fish was performed from 2022 to 2023. METHODS AND RESULTS: Listeria monocytogenes was detected in 3.6% of 783 samples. Listeria monocytogenes was detected more frequently in cold smoked (4.9%) compared to hot smoked (2.0%) samples. The majority (63%) of samples had a water activity that would not prevent the growth of L. monocytogenes. Elevated levels of Enterobacteriaceae (>10 000 CFU g-1) were detected in 4.7% of samples. Listeria monocytogenes was detected more frequently in samples with elevated levels of Enterobacteriaceae. Isolates of L. monocytogenes were compared using whole genome sequencing to historic isolates. Isolates from three samples were the same strain as that associated with a clonal complex (CC) 217 outbreak under investigation and detected despite an earlier product recall. Twelve isolates were CC121 strains and 10 of these belonged to six single nucleotide polymorphism single-linkage clusters with one strain linked to a human case from 2021. One CC415 strain was also linked to a human case. The remaining isolates belonged to CC8, CC9, CC14, CC37, CC31, CC398, CC87, and CC475 with no links to human cases. Investigation of historical isolates revealed that 11 strains were associated with specific manufacturers for up to 10 years. The presence of quaternary ammonium compound efflux genes showed an association with CC. CONCLUSIONS: Diverse L. monocytogenes detected in smoked fish with persistent strains associated with some manufacturing premises. Correlation between presence of L. monocytogenes and high levels of Enterobacteriaceae was detected.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».