Metabolic Reprogramming-Related Genes in Lung Adenocarcinoma: Identification and Prognostic Model Construction
Notice bibliographique
Résumé
Background: Lung adenocarcinoma (LUAD), the predominant histological subtype of lung cancer, persists in presenting a dismally low 5-year overall survival (OS) rate, notwithstanding advancements in treatment modalities. There exists a pressing necessity for the identification of innovative biomarkers that can enhance prognostic assessments and facilitate individualized therapeutic strategies. The objective of this investigation was to clarify the involvement of genes associated with metabolic reprogramming in the progression of LUAD and to evaluate their viability as prognostic indicators. Methods: An analysis of differential gene expression was performed utilizing The Cancer Genome Atlas (TCGA)-LUAD dataset, supplemented by a weighted gene co-expression network analysis (WGCNA). Through intersection analysis focusing on metabolic reprogramming genes (MRGs), pivotal differentially expressed metabolic reprogramming genes (hub DEMRGs) were identified. Consensus clustering categorized patients into subtypes based on these genes. Functional enrichment analysis and immune microenvironment characterization were conducted, followed by Cox and least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression analyses to construct a prognostic risk model. Results: A total of 31 hub DEMRGs were identified. Patients were classified into two distinct subtypes (C1 and C2), with the C2 subtype exhibiting a markedly reduced OS rate. Functional enrichment revealed significant activation of nuclear division and cell cycle pathways in C2. Immune profiling demonstrated an immunosuppressive phenotype in C2, characterized by elevated M2 macrophage infiltration and reduced CD8+ T cells. The risk model based on five critical hub DEMRGs showed robust predictive performance (area under the curve (AUC): 0.68 - 0.71), and high-risk patients displayed unique immune cell infiltration patterns. Conclusions: This research highlights the critical role of MRGs in LUAD prognosis and their potential for clinical application. The identified subtypes and risk model provide insights into tumor heterogeneity and immunosuppressive mechanisms, offering potential targets for individualized therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».