NMR Insights Into the Structural Dynamics of p47, A Key Adaptor Protein of p97 in Golgi Reassembly
Notice bibliographique
Résumé
The Golgi apparatus undergoes systematic disassembly and reassembly during the cell cycle, a process requiring membrane fusion mediated by the AAA+ ATPase p97/VCP and its adaptor p47. While the p97-p47 complex plays a pivotal role in post-mitotic Golgi reassembly, the exact molecular mechanism underlying its function has not been completely understood. In particular, the conformational flexibility and dynamic feature of p47 hinders its structural characterization by cryo-electron microscopy and X-ray crystallography. Here, using NMR spectroscopy, we characterize the conformational dynamics of p47 and investigate its intra- and intermolecular interactions. p47 consists of three folded domains connected by intrinsically disordered regions (IDRs). We show that p47 adopts a "beads-on-a-string" arrangement and identify several regions that undergo microsecond-to-millisecond timescale motions, which may have functional significance. Using paramagnetic relaxation enhancement (PRE) experiments, we capture transient inter-domain and domain-linker interactions, gaining insights into the structural organization of the domains and linkers in p47. Notably, we identify and characterize an intramolecular interaction between a SEP-interacting motif (SIM), located on the flexible linker, and the SEP domain, suggesting a conserved structural and functional feature among SEP-containing p97 adaptors. Additionally, we observed transient intermolecular interactions between p47 molecules, primarily mediated by the SEP domain. These findings provide a comprehensive view of the structural organization and dynamics of p47, shedding light on how its modular architecture and multivalent interactions may modulate p97 activity and assist Golgi membrane reassembly.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».