RASGRP4 is a key factor in KRAS activation mediated by SOS in Y1 mouse tumor cell line
Notice bibliographique
Résumé
The Y1 mouse adrenocortical carcinoma cell line presents amplification of the KRas oncogene and high-basal levels of KRAS-GTP mediated by the GEF SOS. In this research, we developed a dynamic model based on ordinary differential equations of the KRAS-GTP activation mediated by SOS in Y1 cells, which showed that SOS only is not sufficient to reach the high-basal levels of KRAS-GTP experimentally observed for this cell line. Interestingly, a modification in this system, which added another GEF in the model, made the model reach the expected levels of KRAS activation, leading to the hypothesis that there was a missing element in this system. To find this missing element, a PCR panel of RasGEFs was performed and the GEF Rasgrp4 was found highly expressed in parental Y1 cell lines, indicating that this was the missing element in the system. Finally, tumor growth assays in Balb/c-NUDE mice with the Y1 cell versus RASGRP4 CRISPR depleted Y1 cells, showed reduced tumor growth and frequency for the RASGRP4 depleted cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».