Genome-Wide Identification, Evolution, and Expression Analysis of the DMP Gene Family in Peanut (Arachis hypogaea L.)
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Notice bibliographique
Résumé
Peanut (Arachis hypogaea L.) is a globally important oilseed cash crop, yet its limited genetic diversity and unique reproductive biology present persistent challenges for conventional crossbreeding. Traditional breeding approaches are often time-consuming and inadequate, mitigating the pace of cultivar development. Essential for double fertilization and programmed cell death (PCD), DUF679 membrane proteins (DMPs) represent a membrane protein family unique to plants. In the present study, a comprehensive analysis of the DMP gene family in peanuts was conducted, which included the identification of 21 family members. Based on phylogenetic analysis, these genes were segregated into five distinct clades (I–V), with AhDMP8A, AhDMP8B, AhDMP9A, and AhDMP9B in clade IV exhibiting high homology with known haploid induction genes. These four candidates also displayed significantly elevated expression in floral tissues compared to other organs, supporting their candidacy for haploid induction in peanuts. Subcellular localization prediction, confirmed through co-localization assays, demonstrated that AhDMPs primarily localize to the plasma membrane, consistent with their proposed roles in the reproductive signaling process. Furthermore, chromosomal mapping and synteny analyses revealed that the expansion of the AhDMP gene family is largely driven by whole-genome duplication (WGD) and segmental duplication events, reflecting the evolutionary dynamics of the tetraploid peanut genome. Collectively, these findings establish a foundational understanding of the AhDMP gene family and highlight promising targets for future applications in haploid induction-based breeding strategies in peanuts.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle