Effect of Oceanic Islands on an Insect Symbiont Genome in Transition to a Host-Restricted Lifestyle
Notice bibliographique
Résumé
Islands offer unique opportunities to study adaptive radiations and their impacts on host genome evolution. In Hawaiian Pariaconus psyllids, all species harbor the ancient nutritional symbiont Carsonella, while only free-living and open-gall species on younger islands host a second stable cosymbiont, Makana. In contrast, a third cosymbiont, Malihini, appears to be in an early stage of host restriction and genome degradation, making it a valuable model for understanding symbiont evolution during island radiations. Here, we examine Malihini genome evolution across multiple Pariaconus lineages using 16S rRNA sequencing, metagenomics, phylogenetic reconstruction, and microscopy. We find that Malihini is codiversifying with its hosts on the oldest island Kaua'i (kamua group; open- and closed-gall makers) and on the younger islands only in free-living species (bicoloratus group). Comparison of five Malihini genomes-including three newly assembled in this study-shows ongoing genome reduction from a large-genome ancestor (>3,900 protein-coding genes), likely driven by relaxed selection, vertical transmission bottlenecks, and island dispersal over the past 5 million years. On Kaua'i, the galling psyllids appear to depend more heavily on cosymbiont (Malihini) for the biosynthesis of amino acids and B-vitamins than galling species on younger islands-especially closed-gall species, which only have Carsonella. Surprisingly, free-living psyllids on younger islands with all three symbionts show metabolic reliance similar to Kaua'i gall makers. Together, our results demonstrate that island biogeography and host plant ecology shape symbiont losses and codiversification patterns. Malihini represents an early stage of symbiont genome degradation during host restriction, in sharp contrast to its more stable coresidents, Carsonella and Makana.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».