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Enregistrement W4412702538 · doi:10.1101/2025.07.18.665591

Genomic response to sex-separated gene pools

2025· preprint· en· W4412702538 sur OpenAlexafffund
Chloe Melo-Gavin, Karl Grieshop, Aneil F. Agrawal

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaVetenskapsrådetUniversity of Toronto
Mots-clésGeneGeneticsBiologyComputational biology

Résumé

ABSTRACT Males and females experience differences in the strength and direction of selection but discerning the type of genes that are targets of sex differences in selection is complicated by their shared genome. We used experimental evolution in Drosophila melanogaster to partially separate the gene pools of males and females for 130 generations. In six replicate populations, we forced one pool of genetically variable Chromosome 2s to experience patrilinear inheritance (segregating like a Y-chromosome) and male-limited selection. The alternative pool segregated like an X-chromosome and experienced female-biased selection. This allowed alleles which are differentially selected for between the sexes to diverge between these pools, enabling us to gain insight into the type of genes subject to such selection. We find that genes which diverge between these pools have an elevated intersexual genetic correlation( r MF ) for expression on average, consistent with the idea that high genetic correlations may hinder sex-specific adaptation under normal inheritance. Diverged genes were also enriched for moderately male-biased genes whereas female-biased genes were underrepresented. At the SNP level, we find an overrepresentation of diverged SNPs involved in splicing or occurring in the 5’UTR and an underrepresentation of missense or synonymous SNPs, suggesting sex differences in selection for isoform usage.

Conservé avec la notice de tri, où il sert de preuve aux étiquettes ci-dessus.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Le tri à trois modèles

les 5 600 travaux triés →

Les trois modèles l'ont jugé hors champ.

strate : aff_core · poids de sondage : 5595.24 (l'échantillon est stratifié ; tout taux calculé sans le poids est faux)
Claude Opus 4.8OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Experimental evolution study of sex-specific selection in Drosophila.

GPT-5.6 (high)OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

The preprint studies sex-specific selection and genomic divergence in fruit flies, not research practice.

Grok 4.5OUT
genre : empirical
porte sur le Canada: non
confiance: high

Experimental evolution of sex-separated gene pools in Drosophila; domain evolutionary genetics.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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