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Enregistrement W4412704060 · doi:10.1073/pnas.2410945122

Genetic rescue of Florida panthers reduced homozygosity but did not swamp ancestral genotypes

2025· article· en· W4412704060 sur OpenAlexaboutno aff
Diana Aguilar‐Gómez, Yulin Zhang, Alexander Ochoa, Melanie Culver, Robert R. Fitak, David P. Onorato, Kirk E. Lohmueller, Rasmus Nielsen

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of Health
Mots-clésInbreeding depressionBiologyInbreedingPopulationRuns of HomozygosityEffective population sizeGenetic monitoringPopulation fragmentationGenetic loadEvolutionary biologyEcologyZoologyGenetic variationGeneticsGenotypeMicrosatelliteDemographyGeneAlleleSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) occupy a vast geographical range spanning from Canada to Argentina. Due to urbanization and unregulated hunting, pumas in Florida, known as panthers, are the only breeding population east of the Mississippi River. In the 1990s, Florida panthers numbered <30 individuals suffering from inbreeding depression. In 1995, eight pumas from Texas were translocated into southern Florida to mitigate the effects of isolation. This translocation reduced inbreeding depression and increased population size. While genetic rescue is often suggested as a means of ameliorating the effects of small population size, the underlying genetic mechanism and its long-term efficacy remain understudied. We sequenced the genomes of posttranslocation Florida panthers (PTFPs) to elucidate the genomic consequences of genetic rescue. We inferred local ancestry across the genomes of PTFPs and found that no regions have been entirely replaced by Texas ancestry, discarding the possibility of genetic swamping. Furthermore, the beneficial effects of the translocation were likely caused by a reduction in homozygosity, alleviating recessive deleterious load, rather than by a reduction in the number of deleterious variants. We did not find evidence that selection has favored replacement of original Florida DNA with Texas DNA in any systematic fashion. Using simulations, we found that heterozygosity increased in the long-term compared to a no translocation scenario; however, the effects on fitness are more transient. Our findings hold significant implications not only for the management of Florida's panther population, but also for informing strategies for genetic rescue in other wild, inbred populations encompassing broader conservation efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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