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Enregistrement W4412707938 · doi:10.1016/j.xpro.2025.103971

Protocol for assessing mitochondrial cholesterol transport and protein molten globule state in steroidogenic and nonsteroidogenic systems

2025· article· en· W4412707938 sur OpenAlexaff
Himangshu S. Bose, Mahuya Bose, Randy M. Whittal

Notice bibliographique

RevueSTAR Protocols · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMercer UniversityUniversity of FloridaFlorida Department of HealthPfizerAmerican Heart AssociationNational Institutes of HealthMarch of Dimes Foundation
Mots-clésPregnenoloneCholesterol side-chain cleavage enzymeSteroidogenic acute regulatory proteinHormoneChemistryMitochondrionSteroidCholesterolCell biologyBiologyMetabolismBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Steroid hormones are essential for the survival of all mammals for carbohydrate metabolism, stress management, and sexual reproduction. Here, we present a protocol for assessing mitochondrial cholesterol transport and protein molten globule state via measurement of pregnenolone or progesterone synthesis in steroidogenic and nonsteroidogenic cellular systems. We describe steps for cell culture, transfection, and measurement of steroidogenic activity from nonsteroidogenic cells. We then detail procedures for metabolic conversion. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Bose, 1 Bose et al., 2 Pawlak et al., 3 and Prasad et al. 4 • Steps to determine steroidogenic activity by overexpression in nonsteroidogenic cells • Instructions for identifying a dry molten globule state in living cells • Assay steroidogenic activity and molten globule state of biosynthetic protein(s) Publisher’s note: Undertaking any experimental protocol requires adherence to local institutional guidelines for laboratory safety and ethics. Steroid hormones are essential for the survival of all mammals for carbohydrate metabolism, stress management, and sexual reproduction. Here, we present a protocol for assessing mitochondrial cholesterol transport and protein molten globule state via measurement of pregnenolone or progesterone synthesis in steroidogenic and nonsteroidogenic cellular systems. We describe steps for cell culture, transfection, and measurement of steroidogenic activity from nonsteroidogenic cells. We then detail procedures for metabolic conversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,149

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0010,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0450,030

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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