Factors associated with resistance of HIV-1 reservoir viruses to neutralization by autologous IgG antibodies
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUNDAntiretroviral therapy (ART) prevents HIV-1 replication but does not eliminate the latent reservoir, the source of viral rebound if treatment is stopped. Autologous neutralizing antibodies (aNAbs) can block in vitro outgrowth of a subset of reservoir viruses and therefore potentially affect viral rebound upon ART interruption.METHODSWe investigated aNAbs in 31 people with HIV-1 (PWH) on ART.RESULTSParticipants fell into 2 groups based on a high or low fraction of aNAb-resistant reservoir isolates, with most isolates being aNAb-resistant (IC50 > 100 μg/mL). Time on uninterrupted ART was associated with higher aNAb resistance. However, pharmacodynamic analysis predicted that many isolates would be partially inhibited at physiologic IgG concentrations, to the same degree as by single antiretroviral drugs. Steep dose-response curve slopes, an indication of cooperativity, were observed for the rare isolates that were very strongly inhibited (> 5 logs) by aNAbs. Resistance to aNAbs was not fully explained by declining in aNAb titers and may be driven partially by ADCC-mediated elimination of infected cells carrying aNAb-sensitive viruses over long time intervals, leaving only aNAb-resistant viruses, which can contribute to viral rebound.CONCLUSIONInhibition of reservoir viruses by aNAbs may be affected by dose-response curve slope, time on uninterrupted ART, waning of antibody responses, and selection against cells with aNAb-sensitive viruses.FUNDINGThis work was supported by NIH Martin Delaney Collaboratories for HIV Cure Research grant awards UM1AI164556, UM1AI164570, and UM1AI164560, and the Howard Hughes Medical Institute.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».