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Enregistrement W4412730262 · doi:10.1186/s12870-025-06767-5

Transcriptome-based analysis reveals key molecular mechanisms and functional characterization of MaCAX3 gene involved in manganese stress responses in mulberry plants

2025· article· en· W4412730262 sur OpenAlexaff
Jianbin Li, Michael Ackah, Frank Kwarteng Amoako, Aaron T. Asare, Manman Shen, Zhenjiang Wang, Qiang Lin, Changyu Qiu, Meina Zhu, Mengdi Zhao, Weiguo Zhao

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Jiangsu ProvinceGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésBiologyTranscriptomeReactive oxygen speciesGeneBiochemistryLigninToxicityHemicelluloseAbiotic stressGene expressionBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Manganese (Mn) deficiency and toxicity are major constraints on crop production in soil. Plants have evolved cascade strategies and specific mechanisms to tolerate these stresses. Understanding the molecular mechanisms of tolerance to Mn stress is crucial for improving the efficiency of conferring Mn tolerance and phytoremediation, which is intriguing for evolutionary research on plant adaptation to abiotic stresses. In this study, the responses of mulberry to varied concentration levels of Mn (MnSO 4 ), ranging from deficiency (0 mM and 0.03 mM), sufficiency (0.15 mM), and toxicity regimes (1.5 mM and 3 mM) were compared by elucidating the physiological, transcriptome profiling, and functional characterization of the MaCAX3 gene in mulberry leaves. Results The results show that Mn-induced deficiency and toxicity not only trigger an increase in oxidation and antioxidant parameters, including hydrogen peroxide (H 2 O 2 ), lipid peroxidase (LPO), polyphenol oxidase (PPO), and reactive oxygen species (ROS) but also concomitantly improved the activities of total antioxidant capacity (TAC) and hydroxyl radical (•OH) scavenging levels in mulberry. Results of the cell wall structural components show that cellulose, hemicellulose, and lignin contents were significantly higher, except for pectin, in the control (CK) compared to the deficiency and toxicity. Functional validation of the MaCAX3 gene via gene silencing revealed that the heterologous expression of the MaCAX3 gene increased the transport of Mn in yeast, thus inhibiting the toxic effect of Mn relative to the silenced Macax3 -VIGS. Additionally, transcriptome analysis identified a total of 811 differentially expressed genes (DEGs), with 189 and 622 being up- and downregulated, respectively. These DEGs were significantly involved in Mn transport, detoxification, oxidation, antioxidant defense, and cell wall and protein processing, which conferred tolerance to Mn in mulberry plants. Conclusion The study sheds substantial light on key molecular mechanisms and the functional characterization and validation of crucial Mn tolerance genes in mulberry leaves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,660
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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