Evaluation and genome-wide association study of saline–alkali tolerance in high-latitude rice resource populations
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: China is the world's third largest saline-alkali land country, and the breeding of salt-tolerant rice varieties has always been a key focus of rice breeders. Screening and identifying salt-tolerant varieties and exploring related genes are essential for breeding. Methods: In this study, 450 high-latitude resource populations were planted on natural saline-alkali soil for 2 years under 2 treatments. The comprehensive agronomic traits of the populations were evaluated. The principal component and cluster analyses were used to preliminarily group the phenotypes, and individual phenotypes were comprehensively scored and ranked to identify the top 40 saline-alkali tolerant varieties each year. Results: Notably, S321 and S19 were the most saline-alkali tolerant varieties each year. Genome-wide association studies identified one saline-alkali-related position near 6,636,119 bp on chromosome 8 and another near 23,311,931 bp on chromosome 11. Os08g0214233 and Os11g0604900 were the nearest genes from the identified positions, respectively. Gene annotation was used to further screen the polymorphic sites in the associated regions, identifying 17 and 48 genes with 593 variants, including 56 polymorphic sites located in exons. Discussion: This study provided candidate gene loci for the fine mapping of saline-alkali tolerance genes and offered excellent resistant rice resources for the molecular improvement of varieties.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».