Sea lice (Lepeophtheirus salmonis) life stage impacts atlantic salmon transcriptomic responses under different thermal profiles
Notice bibliographique
Résumé
Sea lice ( Lepeophtheirus salmonis ) infestation continues to pose a persistent and escalating challenge to the global salmon aquaculture industry. Given the complexity of host-parasite interactions, family-based transcriptomic studies provide crucial insights into genetic variation in host responses to sea lice, potentially guiding the development of selective breeding programs to manage parasite resistance in Atlantic salmon. This study investigated global gene expression (transcriptomic) responses of the skin and head kidney of Atlantic salmon ( Salmo salar ) from different families following infestation at two distinct stages of sea lice, chalimus II and adult, under varying temperature conditions (10°C and 20°C). RNA sequencing results revealed consistent expression of lice-responsive genes across different families under varying thermal conditions, which allowed the identification of potential biomarkers associated with adult-stage compared to chalimus-stage infestations. Our findings highlight critical physiological disruptions in salmon infested with advanced (adult) stages of lice, including uncontrolled and persistent inflammation, dampened/dysregulated immune responses, and impaired tissue repair at attachment sites. This study provides a comprehensive analysis of the transcriptomic responses of Atlantic salmon to different developmental stages of sea lice under specific temperature conditions (10°C and 20°C), and identifies several novel molecular markers from RNA-seq analysis that may be instrumental in developing targeted control strategies for this economically important parasite.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».