Comparing randomized trial designs to estimate treatment effect in rare diseases with longitudinal models: a simulation study showcased by Autosomal Recessive Cerebellar Ataxias using the SARA score
Notice bibliographique
Résumé
Parallel designs with an end-of-treatment analysis are commonly used for randomised trials, but they remain challenging to conduct in rare diseases due to small sample size and heterogeneity. A more powerful alternative could be to use model-based approaches. We investigated the performance of longitudinal modelling to evaluate disease-modifying treatments in rare diseases using simulations. Our setting was based on a model describing the progression of the standard clinician-reported outcome SARA score in patients with ARCA (Autosomal Recessive Cerebellar Ataxia), a group of ultra-rare, genetically defined, neurodegenerative diseases. We performed a simulation study to evaluate the influence of trials settings on their ability to detect a treatment effect slowing disease progression, using a previously published non-linear mixed effect logistic model. We compared the power of parallel, crossover and delayed start designs, investigating several trial settings: trial duration (2 or 5 years); disease progression rate (slower or faster); magnitude of residual error (σ=2 or σ=0.5); number of patients (100 or 40); method of statistical analysis (longitudinal analysis with non-linear or linear models; standard statistical analysis), and we investigated their influence on the type 1 error and corrected power of randomised trials. In all settings, using non-linear mixed effect models resulted in controlled type 1 error and higher power (88% for a parallel design) than a rich (75% for a parallel design) or sparse (49% for a parallel design) linear mixed effect model or standard statistical analysis (36% for a parallel design). Parallel and delayed start designs performed better than crossover designs. With slow disease progression and high residual error, longer durations are needed for power to be greater than 80%, 5 years for slower progression and 2 years for faster progression ataxias. In our settings, using non-linear mixed effect modelling allowed all three designs to have more power than a standard end-of-treatment analysis. Our analysis also showed that delayed start designs are promising as, in this context, they are as powerful as parallel designs, but with the advantage that all patients are treated within this design.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,085 | 0,721 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».