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Enregistrement W4412775074 · doi:10.3389/fmolb.2025.1612531

Arfs on the Golgi: four conductors, one orchestra

2025· review· en· W4412775074 sur OpenAlexaff
Selma Y. Dejgaard, John F. Presley

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGolgi apparatusBiologyCell biologyEffectorGene knockoutCOPIADP ribosylation factorSecretory pathwayContext (archaeology)Computational biologyGeneticsGeneEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arfs are small Ras-superfamily proteins important for regulating membrane trafficking including the recruitment of vesicular coats as well as a diverse range of other functions. There are five Arfs in humans: two Class I Arfs (Arf1 and Arf3), two Class II Arfs (Arf4 and Arf5) and one Class III Arf (Arf6), with Class I and Class II Arfs present on the Golgi apparatus among other locations. These Golgi Arfs (Arf1, Arf3, Arf4 and Arf5) are highly similar in sequence, and knockout studies have established a complex pattern of redundancy, with Arf4 alone able to support cell survival in tissue culture. Moreover, adding to the complexity, functions of Arfs on distinct membranes can involve non-overlapping sets of effectors (e.g., COPI on cis -Golgi membranes and clathrin adaptors on trans -Golgi network). The three classes of Arfs are found in most metazoans, suggesting biologically important specialization the details of which are beginning to emerge. This review examines recent studies using siRNA and CRISPR/Cas9 knockouts of mammalian Arfs combined with functional assays of the secretory pathway in the context of detailed localization of fluorescently-tagged Arfs by fluorescent and super-resolution microscopy and the existing literature using more conventional techniques. We suggest that specificity of effector recruitment involves additional membrane determinants which need to be considered in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,983
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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