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Enregistrement W4412796164 · doi:10.1101/2025.07.29.667536

The SMARCA5–DMRT1 Pioneer Complex Establishes Epigenetic Priming to Direct Male Germline Development

2025· preprint· en· W4412796164 sur OpenAlexaff
Yuka Kitamura, Yasuhisa Munakata, Hironori Abe, Mengwen Hu, Satoyo Oya, Shanmathi Murugesan, Mahnoor Rizwan, David J. Picketts, Richard M. Schultz, Satoshi H. Namekawa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthToyobo Biotechnology Foundation
Mots-clésGermlineEpigeneticsPriming (agriculture)BiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The establishment of cell type–specific chromatin landscapes is essential for cellular identity, but how these landscapes are generated remains poorly understood. Here, we demonstrate that the chromatin remodeler SMARCA5 establishes epigenetic priming that is required for retinoic acid (RA)–induced differentiation in the male germline. Germ cell–specific deletion of Smarca5 results in a complete loss of differentiating spermatogonia, phenocopying vitamin A-deficient mice that lack RA signaling. During the perinatal transition from prospermatogonia to undifferentiated spermatogonia, SMARCA5 is recruited to binding sites of the pioneer transcription factor DMRT1, which are located at distal putative enhancers and promoters of germline genes. The SMARCA5–DMRT1 pioneer complex establishes chromatin accessibility at these loci, generating poised enhancers and promoters that serve as RA receptor (RAR)–binding sites. Thus, SMARCA5 licenses transcriptional responses to RA that enable spermatogenic differentiation. Our findings uncover a mechanism linking pioneer factor activity to external signal responsiveness. Highlights SMARCA5 is required for spermatogonial differentiation The SMARCA5–DMRT1 pioneer complex establishes epigenetic priming for differentiation SMARCA5 remodels inaccessible DMRT1-binding sites to an accessible state SMARCA5 shapes chromatin states that enable retinoic acid responsiveness

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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