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Enregistrement W4412806724 · doi:10.1186/s12920-025-02188-3

Single-cell sequencing-based study of ferroptosis mechanisms in heat stroke: identification of key biomarkers and dynamic analysis of the immune microenvironment

2025· article· en· W4412806724 sur OpenAlexfundno aff
Defeng Yin, Qin Guo, Hao Jiang, Yiqiang Hu, Lu Liu, Xiang Li, Chenglin Wang, Shilin Li, Kaiyu Jin, Yingchun Hu

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueClimate Change and Health Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSouthwest Medical UniversityConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissement
Mots-clésImmune systemIdentification (biology)Computational biologyBiologyHuman geneticsDNA microarrayBioinformaticsImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Heat stroke, caused by excessive heat production or impaired dissipation, often results from prolonged heat exposure or strenuous activity. Ferroptosis, a novel form of programmed cell death, has been implicated in its pathogenesis, though its mechanisms remain unclear. OBJECTIVE: This study investigates the molecular mechanisms linking heat stroke and ferroptosis using single-cell and transcriptomic analyses to identify diagnostic and therapeutic targets. METHODS: Peripheral blood samples from 29 heat stroke patients, recruited at an early stage of the condition, underwent transcriptome sequencing, and single-cell RNA sequencing was conducted for two representative cases. Ferroptosis-related genes were identified by integrating the FerrDB database, followed by weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and differential gene expression analysis to pinpoint ferroptosis-related genes most characteristic of heat stroke. Functional enrichment analyses, including GO and KEGG pathways, were performed. Single-cell RNA sequencing revealed immune microenvironment alterations and marker genes linked to heat stroke pathogenesis. Receiver operating characteristic (ROC) analysis evaluated the diagnostic potential of these genes. Additionally, pseudotime analysis elucidated cell differentiation trajectories and the roles of key genes. RESULTS: In Dataset 1, 630 differentially expressed genes (546 up-regulated, 84 down-regulated) and 1,979 heat stroke-related genes were identified. Among them, 14 intersected with 1,001 ferroptosis-related genes and were enriched in pathways like fatty acid metabolism, inflammation, and immune regulation. Single-cell sequencing showed increased monocytes and macrophages in heat stroke patients. Five core genes (ACSL1, MAPK14, ALOX5AP, PROK2, and DUSP1) were validated in Dataset 2 with high AUC values (1.0, 1.0, 0.952, 0.976, and 0.881, respectively). These genes were highly expressed in neutrophils, dendritic cells, and monocytes. Pseudotime analysis confirmed their roles in cell differentiation and disease progression. CONCLUSION: ACSL1, MAPK14, ALOX5AP, PROK2, and DUSP1 were identified as novel biomarkers for diagnosing heat stroke. ROC validation confirmed their strong association with the disease, highlighting their potential as diagnostic targets. Pseudotime analysis revealed their consistency in cellular differentiation trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,646
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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