Comparative performance of a commercial and in-house Mp1p antigen-detecting enzyme immunoassay for the rapid diagnosis of talaromycosis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Several antigen-detection assays have been developed for the rapid diagnosis of talaromycosis, but their utility has been limited by a lack of commercial options. The aim of this study was to perform a head-to-head comparison of the performance of our in-house monoclonal antibody-based Mp1p antigen-detecting enzyme immunoassay (EIA) with its recently-developed commercial platform. METHODS: In this diagnostic accuracy, retrospective, case-cohort study, we compared the sensitivity, specificity, positive likelihood ratio (LR+) and negative likelihood ratio (LR-) of the commercial Wantai Mp1p EIA versus our in-house Mp1p EIA on paired plasma and urine samples from 424 hospitalized adults with advanced HIV disease, including 224 cases of proven talaromycosis, where Talaromyces marneffei was isolated in culture of blood or other clinical specimens, and 200 controls diagnosed with a range of other opportunistic infections. All participants were randomly selected from prospective cohorts recruited between 2011 and 2019 from five centers in Vietnam. RESULTS: The sensitivity of the Wantai and in-house Mp1p EIAs were comparable in plasma (95.1% vs 92.4%, P = 0.11), in urine (91.5% vs 87.1% P = 0.07), and in combined testing of plasma and urine (96.4% vs 96.0%, P = 1.00), where talaromycosis was diagnosed based on the positivity of either specimen. The specificity of the Wantai and in-house Mp1p EIAs were consistently high in plasma, in urine, and in combined testing (93 - 97%). The Wantai and in-house Mp1p EIAs provided substantially higher sensitivity than blood culture detection (96.4% and 96.0% vs 78.6%, P < 0.001). For both EIAs, LR+ were greater than 10 and LR- were less than 0.1, which increases the confidence to rule in or rule out talaromycosis. CONCLUSIONS: The diagnostic performance of the Wantai Mp1p EIA was comparable to our validated in-house Mp1p EIA, and significantly more sensitive than blood culture, offering a standardized tool for the rapid diagnosis of talaromycosis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».