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Enregistrement W4412835653 · doi:10.1101/2025.08.01.668179

A sustained Hox program delineates brainstem neurons essential for breathing

2025· preprint· en· W4412835653 sur OpenAlexaff
Matthew T. Moore, Minshan Lin, Alicia N. Vagnozzi, Raquel López de Boer, Elyse M. Brozost, Lucie Jeannotte, Polyxeni Philippidou

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience of respiration and sleep
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCase Western Reserve UniversityNational Institute of Neurological Disorders and StrokeSt. Jude Children's Research Hospital
Mots-clésBrainstemNeuroscienceBiologyExcitatory postsynaptic potentialBreathingNeuronMotor neuronAnatomyInhibitory postsynaptic potentialSpinal cord

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Respiratory neurons in the brainstem must diversify and acquire unique properties during development to enable breathing at birth. Dbx1-expressing progenitors give rise to functionally and molecularly distinct excitatory respiratory populations, including rhythm-generating pre-Bötzinger complex (preBötC) neurons and phrenic motor neuron (MN)-projecting rostral Ventral Respiratory Group (rVRG) neurons. These neurons are organized rostrocaudally within the ventral respiratory column (VRC) but, despite their critical functions in breathing, the mechanisms that control their organization and diversification are not well understood. Here, we generate a novel genetic tool to label brainstem neurons within the VRC. We find that rVRG neurons selectively express Hox5 genes through postnatal stages. Selective deletion of all Hox5 paralogs from Dbx1 -derived neurons leads to respiratory dysfunction, perinatal death, and changes in the pattern and amplitude of phrenic MN firing. We show that Hox5 inactivation leads to a caudal expansion of putative preBötC neurons, likely at the expense of the rVRG. Collectively, our findings indicate that Hox5 proteins are required for the delineation and functional specialization of excitatory brainstem neurons essential for breathing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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