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Enregistrement W4412847718 · doi:10.3114/sim.2025.112.03

Chemodiversity of <i>Penicillium</i> isolated from alpine and arctic environments, including ten new species

2025· article· en· W4412847718 sur OpenAlexaff
David P. Overy, Jens C. Frisvad, Thomas E. Witte, Carmen Hicks, Anne Hermans, Amanda Sproule, Gerry Louis-Seize, Keith A. Seifert, Neriman Yılmaz, Jeffrey L. Price, N.I. van Vuuren, Cobus M. Visagie

Notice bibliographique

RevueStudies in Mycology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensCarleton UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArcticBiologyPenicilliumEcologyThe arcticZoologyGeographyBotanyOceanography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polar, high altitude montane and cold desert environments harbour only sparse plant life and often remain frozen for extended periods. Because of their remoteness, often combined with restricted access, such regions are rarely visited and the fungal biodiversity of the soils is scarcely studied. Despite this, when such studies are undertaken, psychrophilic Penicillium species are often reported and the isolates exhibit a high spectrum of biologically species concepts and provide information to characterize variation within species or populations. During large scale fungal isolation surveys exploring new psychrophilic fungi from high altitude alpine and arctic tundra soils, several undescribed Penicillium species were discovered. A polyphasic taxonomic approach was adopted to formally describe ten new species using multigene phylogenetic analyses and phenotypic characterizations including secondary metabolite production, colony characters, and microscopic analysis of morphological structures. Using untargeted metabolomics and molecular networking tools, an emphasis was made to characterize, compare and discuss in depth, the chemical diversity associated with these new Penicillium species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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