Sedimentary <scp>DNA</scp> Metabarcoding and Indigenous Knowledge Reconstruct Natural and Anthropogenic Disturbances to a Freshwater Lake in the Oil Sands Region of Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Sedimentary DNA (sedDNA), a form of environmental DNA (eDNA) shed by aquatic organisms and preserved in sediment, is crucial for reconstructing historical community compositions in aquatic ecosystems. In Cowpar Lake (Dene name: Doghostú), Alberta, a significant landslide event in the early 1940s CE impacted the lake's geochemistry and fish populations, as documented by Indigenous Knowledge from the Chipewyan Prairie First Nation and corroborated by targeted fish sedDNA analyses. The present study used 18S rRNA and cytochrome oxidase I (COI) genes for DNA metabarcoding of a sediment core from Cowpar Lake to assess the effect of the documented landslide and to reconstruct the historical community composition of eukaryotic functional trophic groups, including photoautotrophs, mixotrophs, parasites, and consumers. Between 1948 and 1956 CE, a notable shift in community composition occurred, with a decline in the alpha diversity of eukaryotic amplicon sequence variants. The increased primary productivity and terrestrial organic input post‐1950 is correlated with an increased diversity of phototrophs and mixotrophs, suggesting potential algal blooms. While parasite diversity remained stable, consumer diversity declined, likely due to increased microbial respiration of organic matter, reducing oxygen levels and making the lake less hospitable for consumers like whitefish, which eventually disappeared in the lake. The reconstructed eukaryotic community profiles from sedDNA were consistent with Indigenous Knowledge of natural changes around the lake. The present study highlights the potential of braiding sedDNA data with Indigenous Knowledge to reconstruct long‐term changes in aquatic communities, offering high‐resolution baseline data for environmental monitoring and a deeper understanding of how freshwater systems respond to natural and human‐induced impacts.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».