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Enregistrement W4412855441 · doi:10.1038/s41467-025-62266-z

The genomic history of Iberian horses since the last Ice Age

2025· article· en· W4412855441 sur OpenAlexaff
Jaime Lira Garrido, Gaétan Tressières, Loreleï Chauvey, Stéphanie Schiavinato, Laure Tonasso‐Calvière, Andaine Seguin‐Orlando, John Southon, Beth Shapiro, Clément P. Bataille, Julie Birgel, Stefanie Wagner, Naveed Khan, Xuexue Liu, José María Rodanés Vicente, Jesús Vicente Picazo Millán, Natàlia Alonso, Isidro Aguilera, Adriano Orsingher, Angela Trentacoste, Xavier Payà, Marta Morán, María Pilar Iborra Eres, Silvia Albizuri, Sílvia Valenzuela, Imma Mestres Santandreu, Montserrat Durán i Caixal, Jordí Principal, Jordi Huguet, Xavier Esteve, Nohemi Sala, Adrián Pablos, Patricia Martín, Josep María Vergès, Rodrigo Portero, Pablo Arias Cabal, Roberto Ontañón Peredo, Cleia Detry, Cristina Luı́s, João Luís Cardoso, Aren M. Maeir, Maria João Valente, Elena Grau, Vicent Estall I Poles, Ana Miguélez González, Armelle Gardeisen, Michele Cupitò, U. Tecchiati, Daniel G. Bradley, Liora Kolska Horwitz, Esther Rodríguez González, Ariadna Nieto‐Espinet, Pere Rosselló Bover, Rosa Ruiz Entrecanales, Ignasi Garcés Estallo, Joaquín Jiménez Fragoso, Sebastián Celestino, Ludovic Orlando

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésEvolutionary biologyComputational biologyBiologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Horses have inhabited Iberia (present-day Spain and Portugal) since the Middle Pleistocene, shaping a complex history in the region. Iberia has been proposed as a potential domestication centre and is renowned for producing world-class bloodlines. Here, we generate genome-wide sequence data from 87 ancient horse specimens (median coverage = 0.97X) from Iberia and the broader Mediterranean to reconstruct their genetic history over the last ~26,000 years. Here, we report that wild horses of the divergent IBE lineage inhabited Iberia from the Late Pleistocene, while domesticated DOM2 horses, native from the Pontic-Caspian steppes, already arrived ~1850 BCE. Admixture dating suggests breeding practices involving continued wild restocking until at least ~350 BCE, with IBE disappearing shortly after. Patterns of genetic affinity highlight the far-reaching influence of Iberian bloodlines across Europe and north Africa during the Iron Age and Antiquity, with continued impact extending thereafter, particularly during the colonization of the Americas. Horses have lived in Iberia since the Ice Age. Using ancient genomes to study their history, Lira Garrido et al. reveal a local wild lineage lasting until Late Iron Age, and highlight the far-reaching influence of Iberian bloodlines across Europe and north Africa during the Iron Age and beyond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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