Characterisation of β-tubulin isotypes in <i>Uncinaria stenocephala</i> and implications for benzimidazole resistance in hookworms
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Uncinaria stenocephala is a widespread hookworm of dogs across Europe, Canada, southern Australia, and other temperate regions, where it often outnumbers infections caused by Ancylostoma caninum . Although a putative β-tubulin isotype-1 mutation associated with resistance has been detected in U. stenocephala , clinical resistance to benzimidazoles has not yet been confirmed. Benzimidazole resistance is primarily linked to single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the β-tubulin isotype-1 gene; however, the β-tubulin genes of U. stenocephala have not been fully characterised. We aimed to identify β-tubulin genes and confirm the coding sequences for key residues (Q134, F167, E198, and F200) in the β-tubulin isotype-1 gene of the U. stenocephala genome. Two U. stenocephala specimens were subjected to Illumina sequencing, and species identity was confirmed through morphological and molecular analysis using ITS rDNA and cox-1 markers. Genome assembly revealed the presence of β-tubulin isotype-1 (10 exons) and isotype-2 (9 exons), both homologous to β-tubulins from other hookworms ( A. caninum , A. ceylanicum , A. duodenale and Necator americanus ). The β-tubulin isotype-1 protein sequence of U. stenocephala contained two variable residues (S37Q and G441A) compared to other hookworm sequences. While the isotype-2 protein sequence was conserved among Ancylostoma species, U. stenocephala exhibited six distinct polymorphisms (E39D, T40S, N115S, L130I, A287S, T439G). The benzimidazole-susceptible residues (Q134, F167, E198, F200) were present in the β-tubulin isotype-1 protein sequence. Characterisation of the complete coding regions of β-tubulin isotypes 1 and 2 enables population-level screening for benzimidazole resistance-associated SNPs and provides a foundation for future epidemiological studies in U. stenocephala . Highlights β-tubulin isotypes-1 and -2 were fully characterised in Uncinaria stenocephala Key benzimidazole-susceptible residues were confirmed in β-tubulin isotype-1 β-tubulin isotypes-1 and -2 enables SNP screening and resistance surveillance efforts Abstract Figure
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».