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Enregistrement W4412864574 · doi:10.1101/2025.07.31.25332511

Distinct Neurodevelopmental Signatures of Sex-Specific Transcriptome-Based Polygenic Risk Scores for Depression

2025· preprint· en· W4412864574 sur OpenAlexafffund
Sarah Rashid, Kevan Clifford, Fernanda C. Dos Santos, Yuliya S. Nikolova

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of CalgaryCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre for Addiction and Mental Health Foundation
Mots-clésMajor depressive disorderTranscriptomeDepression (economics)Sex characteristicsPsychologyClinical psychologyMedicineGeneBiologyInternal medicinePsychiatryGene expressionCognitionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Major depressive disorder (MDD) impacts females and males differently and post-mortem gene expression profiling reveals distinct transcriptomic signatures of the disorder in each sex. Using genes that are transcriptionally altered in MDD in both sexes, we recently developed a novel transcriptome-based polygenic risk score (tPRS), which had sex-specific associations with brain structure and depressive symptoms in both adolescents and adults. Identifying the neurodevelopmental signatures of genetically-induced shifts toward a depression-like brain transcriptome in each sex during a crucial stage, when sex differences in MDD vulnerability initially manifest, could provide useful information about the developmental pathways of early MDD risk. Leveraging sex-specific MDD gene expression data, we sought to develop female- and male-specific tPRSs (tPRS-F and tPRS-M, respectively) and evaluate their impact on regional cortical thickness, cortical surface area, subcortical volume, and depressive symptoms at baseline and 2-year follow-up in a developmental sample of 5002 adolescents (46.6% female, aged 8.9-11.0). In males, tPRS-M was associated with higher depressive symptoms at both timepoints and thicker left posterior cingulate at follow-up. In females, tPRS-F was associated with lower volumes of the right accumbens area, right caudate, and bilateral hippocampi at follow-up. Subcortical volumes of the right caudate and right hippocampus further mediated an indirect effect of tPRS-F on depressive symptoms. For each sex-specific PRS, no effects emerged in the opposite sex. Our findings suggest that sex-specific depression-like shifts in gene expression may contribute to unique vulnerability phenotypes for future MDD risk via distinct mechanisms in each sex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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