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Enregistrement W4412866666 · doi:10.1101/2025.08.01.668080

Comparative transcriptome profiles of first-stage larvae and adult female <i>Dracunculus medinensis</i> (Guinea worm)

2025· preprint· en· W4412866666 sur OpenAlexaff
Hassan Hakimi, Sabina Beilstein, Michael J. Yabsley, Christopher A. Cleveland, Lucienne Tritten, Guilherme G. Verocai

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLarvaBiologyZoologyTranscriptomeDracunculiasisHelminthsEcologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dracunculus medinensis , also called the Guinea worm, is a nematode that causes dracunculiasis, a debilitating neglected tropical disease in humans. The parasite is currently targeted by the global Guinea Worm Eradication Program (GWEP). Historically, GWEP in endemic countries have focused on interrupting transmission of the disease through intervention such as isolation and management of patients, health education, provision of improved water sources and promotion of filtering drinking water to avoid ingestion of the copepod intermediate host (IH) that may contain infectious third-stage larvae. The recent shift of Guinea worm infections in animals - particularly domestic dogs - has introduced an additional challenge to the eradication program, underscoring the urgent need for diagnostics and therapeutics. Understanding the parasite biology and survival strategies in the mammalian host, the copepod IH, and fresh water is pivotal to identifying new control measures. Comparative transcriptomic analysis provides a powerful tool to uncover the molecular mechanisms underlying parasite survival and adaptations. Here, we compared the transcriptome of adult gravid female and first-stage larvae (L1), the stage infective for the copepod IH. Comparative transcriptomic analysis of two adult females and their L1 revealed an upregulation of genes involved in translation, transcription, and DNA repair in L1, likely reflecting adaptations essential for survival in freshwater and subsequent infection of copepods. Additionally, genes involved in cuticle formation were upregulated in adult females highlighting the role of cuticle integrity in retaining millions of L1 until the gravid female worm emerges. We identified highly expressed genes in the adult female that may represent promising candidates for diagnostic markers. This study provides novel insights into the biology of the Guinea worm by examining the transcriptome of L1 and adult female stages. These findings could support the development of novel diagnostics and therapeutics to advance the ongoing eradication effort. Authors summary Guinea worm disease is caused by the nematode Dracunculus medinensis, a parasitic worm responsible for a debilitating neglected tropical disease in humans and targeted for global eradication. Infection occurs through the consumption of contaminated drinking water with the infective larval stage harbored within fresh water crustacean copepods - the intermediate host of the parasite. The high number of Guinea worm infections in animals specially dogs poses a significant challenge to eradication, as infected animals act as reservoirs, contributing to the parasite’s persistence in the environment. Furthermore, the absence of early diagnostic tools and effective therapeutics complicates disease control. In this study, we performed a comparative transcriptome analysis of adult female Guinea worms and their first-stage larvae. We identified highly expressed genes in the adult female that may represent promising candidates for diagnostic markers. Additionally, we found genes and pathways upregulated in first-stage larvae which are likely essential for survival in freshwater and subsequent infection of copepods. Our study provides insight into the molecular mechanisms underlying Guinea worm survival across life stages and environments. These findings aim to support the development of novel diagnostics and therapeutics to advance ongoing eradication efforts of this neglected tropical disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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