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Enregistrement W4412873254 · doi:10.1101/2025.07.17.25331703

Development of polyphenotypic scores to prioritize detection of <i>G6PD</i> rs1050828-T carriers in African and African American populations

2025· preprint· en· W4412873254 sur OpenAlexaff
Tianyuan Lu, David D. Stein, Wenmin Zhang, Yuval Itan, Andrew D. Paterson

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Health and Biochemistry
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesDivision of Graduate EducationNational Human Genome Research InstituteMedical Research CouncilNational Heart, Lung, and Blood InstituteNorthwest Regional Development AgencyWellcome TrustBritish Heart FoundationNational Institutes of HealthCancer Research UKUniversity of Wisconsin-MadisonAndrea and Charles Bronfman Philanthropies
Mots-clésAfrican americanGeographyDemographyPolitical scienceEthnologySociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction The G6PD missense variant rs1050828-T is common in African and African American populations. It lowers HbA1c levels independent of glycemia, increasing the risk of underdiagnosis or delayed diagnosis of diabetes. We aimed to develop polyphenotypic scores (PPS) using routinely collected phenotypes to identify likely carriers. Materials and Methods Using data from 31,083 African or African American participants in the All of Us Research Program (AoU), we developed sex-specific PPS through multi-stage variable selection. We validated the PPS in independent African or African American individuals from AoU (N = 8,846), BioMe Biobank (N = 8,839), and UK Biobank (N = 6,811), and evaluated their utility among individuals without diagnosed diabetes. Results The PPS achieved an area under the receiver operating characteristic curve ranging from 0.7614 to 0.8686 in males and from 0.6033 to 0.6933 in females for identifying rs1050828-T carriers. Among individuals without diagnosed diabetes and with HbA1c &lt;6.5%, PPS-based screening reduced the number needed to screen for identifying one carrier by 65-90% in males and 40-60% in females, compared to random screening. Discussion The PPS may help identify likely rs1050828-T carriers in African and African American populations, supporting prioritization for targeted genetic testing or alternative diagnostic approaches for diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,257
Score d'incertitude au seuil0,885

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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