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Enregistrement W4412873859 · doi:10.1101/2025.07.16.665198

Molecular Insights into Long COVID: Plasma Proteomics Reveals Oxidative Stress, Coagulation Cascade Activation, and Glycolytic Imbalance

2025· preprint· en· W4412873859 sur OpenAlexafffund
Mohammad Mobarak H Chowdhury, A Quenum, Christine Rioux‐Perreault, Jean‐François Lucier, Subburaj Ilangumaran, Alain Piché, Hugues Allard‐Chamard, Sheela Ramanathan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Sherbrooke
Mots-clésOxidative stressGlycolysisCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ProteomicsOxidative phosphorylationCascadeCoagulation2019-20 coronavirus outbreakBiologyComputational biologyChemistryMedicineGeneInternal medicineGeneticsVirologyBiochemistryEnzymeDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Persistent symptoms following SARS-CoV-2 infection are the hallmark of post-COVID condition (PCC), also referred to as long COVID. However, our knowledge is limited on the underlying molecular mechanisms. In this study, we performed data-independent acquisition mass spectrometry plasma proteomics (DIA-MS) to identify molecular alterations associated with PCC. DIA-MS proteomic analysis revealed a few proteins linked to oxidative stress that had altered expression. Notably, PCC samples exhibited downregulation of the antioxidant protein peroxiredoxin 6 (PRDX6) and upregulation of oxidative stress-associated proteins particularly vanin-1 (VNN1) and paraoxonase-3 (PON3). Additionally, the PCC group showed significantly higher levels of six proteins (PCSK9, CST3, C1Q, CPB2, KNG1 GAPDH), which were linked to pathways involving glycolysis, complement and coagulation cascades, and inflammation. Oxidative stress analysis confirmed that PCC samples had significantly higher levels of DNA damage (8-OHdG) than the convalescent group, whereas antioxidant markers, such as reduced and oxidized glutathione (GSH and GSSG), were significantly lower in PCC samples than in uninfected controls. Our observations point towards ongoing oxidative and inflammatory processes in PCC and suggest potential targets for biomarker development and therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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