High-throughput Imaging for Everyone: New Designs for Parallel Multiwell Imaging
Notice bibliographique
Résumé
Many life-science experiments require capturing images from different samples in multiwell plates. Most use robotics to move the microscope field of view to sequentially sample each well, generating a series of short measurements. Some assays, however, require continuous long-duration recordings: slowly evolving processes (metastasis, organoid or embryo development), unpredictable dynamical event (cardiac transitions to arrhythmia), and behavioral studies in model organisms (zebrafish, C Elegans) must be imaged in parallel if replicates are required. Continuous measurements in many samples have been achieved by using a wide-field lens or using many detectors[1-3], however these approaches greatly reduce spatial resolution or increase system cost. The RAP microscope[4,5] was designed for continuous, long-term recordings of dozens of wells at full resolution (Fig 1A). RAPs optical path allows for changes in the FOV through microsecond light source switching with a fast light-emitting diode (LED) array. Thus, RAP can collect images from different wells where the number of wells is limited only by the camera’s frame rate. A fast camera allows RAP to revisit each well quickly enough to effectively observe them in parallel. This presentation describes new modalities for the RAP system that allow parallel image capture without LED switching (Fig 1B). This new modality bypasses one of the limits intrinsic in the original design, where the number of samples depended on the camera frame rate. This enables the efficient use of high-resolution, lower-frame rate sensors for high throughput imaging while also simplifying the optical path and electronics of the original RAP scope. These designs are being incorporated into an open-source microscope platform for low-cost continuous high-throughput imaging. Different RAP configurations. A) LEDs illuminate samples in sequence, so each acquired frame (t1,t2…) is of a different sample; B) LEDS illuminate samples in parallel, and the optical path is altered so several samples are projected onto different locations of the sensor.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».