Research on Phylogenesis and Species Definition of <i>Oxyeleotris marmoratus</i> Based on Mitochondrial Genome
Notice bibliographique
Résumé
Marble goby ( Oxyeleotris marmorata ) is a freshwater fish with high economic value in aquaculture and widespread distribution in Southeast Asia. In this study, phylogenetic analysis of marble goby and related groups was performed using mitochondrial genome data from previous studies, and molecular population genetics was used to explore their species boundaries. Many results showed that the mitochondrial genome of marble goby is about 16.5 kb in length, encoding 13 protein genes, 22 tRNA genes and 2 rRNA genes, and the gene structure is consistent with that of typical bony fish. The phylogenetic tree shows that marble goby belongs to the family Channidae of the suborder Goby in fish classification, and is clearly differentiated from closely related groups such as the family Oxyeleotris (mudskippers, etc.) and the family Goby. The mitochondrial genetic differences between different geographical populations within the species are low (for example, the COI genetic distance between the artificially cultured population and the wild population is only 0.66%), but obvious genetic differentiation is still observed between the large river basins, suggesting the possible existence of cryptic lineages. Closely related species that are difficult to distinguish by morphological identification can be identified by molecular data. Species delimitation analysis based on mitochondrial sequences supports that the marble goby is a single species, but it is recommended to combine nuclear genome data for comprehensive taxonomic verification. This study emphasizes the importance of combining morphological characteristics with molecular evidence for species delimitation, and puts forward conservation and management recommendations for the phylogeographic pattern of marble goby in the Mekong region. The research results provide a scientific basis for fish taxonomy, species conservation and aquaculture breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».