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Enregistrement W4412927362 · doi:10.5376/ija.2025.15.0012

Research on Phylogenesis and Species Definition of <i>Oxyeleotris marmoratus</i> Based on Mitochondrial Genome

2025· article· en· W4412927362 sur OpenAlexvenueno aff
Linhua Zhang, Lingfei Jin

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Aquaculture · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogenesisMitochondrial DNABiologyGenomeEvolutionary biologyGeneticsZoologyComputational biologyPhylogeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marble goby ( Oxyeleotris marmorata ) is a freshwater fish with high economic value in aquaculture and widespread distribution in Southeast Asia. In this study, phylogenetic analysis of marble goby and related groups was performed using mitochondrial genome data from previous studies, and molecular population genetics was used to explore their species boundaries. Many results showed that the mitochondrial genome of marble goby is about 16.5 kb in length, encoding 13 protein genes, 22  tRNA  genes and 2  rRNA  genes, and the gene structure is consistent with that of typical bony fish. The phylogenetic tree shows that marble goby belongs to the family Channidae of the suborder Goby in fish classification, and is clearly differentiated from closely related groups such as the family Oxyeleotris (mudskippers, etc.) and the family Goby. The mitochondrial genetic differences between different geographical populations within the species are low (for example, the COI genetic distance between the artificially cultured population and the wild population is only 0.66%), but obvious genetic differentiation is still observed between the large river basins, suggesting the possible existence of cryptic lineages. Closely related species that are difficult to distinguish by morphological identification can be identified by molecular data. Species delimitation analysis based on mitochondrial sequences supports that the marble goby is a single species, but it is recommended to combine nuclear genome data for comprehensive taxonomic verification. This study emphasizes the importance of combining morphological characteristics with molecular evidence for species delimitation, and puts forward conservation and management recommendations for the phylogeographic pattern of marble goby in the Mekong region. The research results provide a scientific basis for fish taxonomy, species conservation and aquaculture breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil0,408

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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