MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4412927514 · doi:10.5376/ijms.2025.15.0004

Evolutionary History of Decapod Shrimp Based on Comparative Genomics

2025· article· en· W4412927514 sur OpenAlexvenueno aff
Fei Zhao, Jinni Wu

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Marine Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFish Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésShrimpGenomicsFisheryComparative genomicsBiologyEvolutionary biologyZoologyGeneticsGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Decapod shrimps include shrimps, prawns, crayfishes and other groups, and have important research value in terms of biodiversity and evolutionary adaptation. In recent years, with the development of sequencing technology, a large number of shrimp genomes have been deciphered, providing unprecedented opportunities for revealing their evolutionary history based on comparative genomics. This article reviews the diversity and phylogeny of decapod shrimps and the latest progress in shrimp genome resources, focusing on the application of comparative genomics in clarifying the evolutionary relationships, key evolutionary events and environmental adaptation mechanisms of shrimps. For example, through genome comparative analysis, researchers found that the explosive expansion of simple repeat sequences (SSR) in the shrimp genome is closely related to its adaptive evolution; the genomes of eusocial species such as pistol shrimps have significantly expanded due to transposon accumulation. In a case study, we introduce how comparative genomic analysis of the Alpheidae family reveals the relationship between social behavior and genome evolution. Finally, the future direction of comparative genomics of decapod shrimps is prospected, such as deepening pan-genome construction and functional genome verification, to further reveal the full picture of shrimp evolutionary history. This article aims to show that comparative genomics has become an indispensable tool in the study of decapod shrimp evolution, providing a new perspective for understanding the evolution and adaptation of marine organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,354
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Marine ScienceMême sujetFish Biology and Ecology StudiesTravaux en français237 207