Variation in HIV-1 Tat and Vpr protein amino acid sequences and its association with vascular health measures in a South African cohort: an exploratory study
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Human immunodeficiency virus (HIV)-1 is associated with adverse cardiovascular-related outcomes. Subtype-specific variations in the amino acid sequences of Tat and Vpr HIV-1 proteins are associated with differential clinical outcomes in people living with HIV (PLHIV). Given the diverse clinical outcomes related to different HIV subtypes, it is crucial to evaluate the variations in the sequence of Tat and Vpr amino acids in geographical regions where subtype C predominates, such as South Africa. This study aimed to determine whether specific Tat and Vpr protein amino acid variants (alone or in combination) are associated with vascular health measures and predict incident hypertension and all-cause mortality over a five-year period. METHODS: A cohort of n = 60 treatment-naïve PLHIV at baseline and n = 35 at a five-year follow-up was investigated. Standardized vascular health measures, including carotid intima-media thickness (cIMT), cross-sectional wall area (CSWA) and carotid-radial pulse wave velocity (crPWV), as well as Sanger sequencing for Tat/Vpr analysis, were performed. The associations of vascular health measures with Tat and Vpr amino acid variants were investigated. RESULTS: We found that the variation in amino acid sequence in Tat only (p = 0.039) and Tat/Vpr (p < 0.001) were associated with crPWV at baseline. Variation in the Tat and Vpr amino acid sequence did not predict incident hypertension in five years or all-cause mortality. CONCLUSION: The variants of the Tat and Vpr amino acid sequence were associated with arterial stiffness, which may be an underlying mechanism for cardiovascular disease development in PLHIV.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».