Isotopologue Ratios Identify <sup>13</sup> C‐Depleted Biomarkers in Environmental Samples Impacted by Methane Turnover
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Rationale The stable carbon isotopic composition (δ 13 C) of individual lipids is of great value in studying carbon cycling. Among those, microbial lipids in sediments impacted by high methane turnover stand out due to their uniquely depleted isotopic fingerprint. However, gas chromatography/isotope ratio mass spectrometry (GC/irMS) is limited to volatile compounds, whereas intact polar lipids require extensive preprocessing, which results in the loss of chemotaxonomic information. Expanding compound‐specific isotopic information to intact polar lipids would enhance insights into the microbial turnover of methane. Methods We performed ultra‐high‐performance liquid chromatography/electrospray ionization/high‐resolution mass spectrometry (UHPLC/ESI/HRMS) to analyze standards of archaeol and lipid extracts from a diverse set of sediment samples of a hydrothermal methane seep system. Using the ratio of the M1 isotopologue over the monoisotopic isotopologue M0, we calculated the δ 13 C values of archaeol and various polar, non‐GC‐amenable lipids. The δ 13 C values of archaeol obtained via ratios were compared to those measured via GC/irMS. Results δ 13 C values of archaeol determined in natural samples via GC/irMS and the UHPLC/HRMS approach were strongly correlated ( R 2 = 0.94; N = 76–82) across a wide range of δ 13 C values (GC‐irMS = −119‰ to −34‰). Biomarkers associated with methane turnover consistently yielded δ 13 C values below −60‰, whereas the δ 13 C values of compounds presumably associated with the photosynthesis‐based food web remained above −45‰. UHPLC/HRMS measurements of archaeol standard further indicated that δ 13 C values can be reliably determined across an M0 signal‐intensity range of approximately one order of magnitude. Conclusions Our results highlight that the M1/M0 ratio from UHPLC/HRMS measurements can be utilized to evaluate the carbon isotopic fingerprint of non‐GC‐amenable lipids and to reliably detect lipid biomarkers putatively associated with microbial methane turnover carrying extremely depleted isotopic signatures. This paves the way for a comprehensive exploration of intact lipids associated with microbial methane turnover in environmental samples.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».