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Enregistrement W4412960891 · doi:10.1101/2025.07.17.663733

Airway epithelial SARS-CoV-2 infectious and repair responses: relationships to age, sex, and post-COVID pulmonary syndromes

2025· preprint· en· W4412960891 sur OpenAlexaff
Hong Dang, Caitlin E. Edwards, Takafumi Kato, Boris Reidel, Rita M. Meganck, Charles R. Esther, Camille Ehré, M. Leslie Fulcher, Alexis B. Bailey, Michelle R. Cooley, Yu Mikami, Takanori Asakura, Padraig Hawkins, Minako Saito, Jeffrey L. Myers, Kristine E. Konopka, Firoozeh V. Gerayeli, Hye Yun Park, Don D. Sin, Alessandra Livraghi-Butrico, Kenichi Okuda, Raymond J. Pickles, Sabra L. Klein, Scott H. Randell, Wanda K. O’Neal, Ralph S. Baric, Richard C. Boucher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLong-Term Effects of COVID-19
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesState of North Carolina
Mots-clésImmunologyAirwayCystic fibrosisMedicineBiologyRespiratory epitheliumRespiratory systemInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The long-term pulmonary sequelae of SARS-CoV-2 respiratory infections reflect infection severity, innate and adaptive immunity, and respiratory epithelial repair. This study investigated the acute and reparative responses as a function of age and sex in primary human bronchial epithelial (HBE) cultures utilizing a 14-day SARS-CoV-2 infection protocol. SARS-CoV-2 infection peaked at 3 days post-infection (dpi) with an ∼ 2 log titer suppression at 14 dpi. SARS-CoV-2 infection induced interferon, interferon-induced gene, and cell damage responses. No age- or sex-dependent effects on SARS-CoV-2 infection were detected. Airway epithelia repaired to an abnormal mucus metaplastic/inflammatory state that reflected potentially beneficial and adverse consequences at 14 dpi. Repair processes were infection severity-dependent, not sex-dependent, and were more robust in young donor cultures. Analyses of long-COVID subjects with persistent pulmonary fibrosis or persistent bronchitic airway diseases exhibited expression of HBE 14 dpi failed repair gene signatures, including ISG gene signatures. Human airway epithelial repair post-SARS-CoV-2 is prolonged and incomplete in vitro over 14 days, and persistently abnormal repair may contribute to phenotypes of people with long-COVID pulmonary syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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