MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4412967155 · doi:10.1101/2025.07.14.664745

Sampling intensity and temporal persistence of airborne eDNA in partially enclosed spaces

2025· preprint· en· W4412967155 sur OpenAlexafffund
Nina R. Garrett, Orianne Tournayre, Joanne E. Littlefair, Natalya Ivanova, Tiffany Jedrecka, Andrew G. Briscoe, Amanda M. Naaum, Nancy B. Simmons, Elizabeth L. Clare

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of GuelphYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEnvironment and Climate Change Canada
Mots-clésEnvironmental DNASampling (signal processing)Environmental scienceEcologyBiodiversitySpecies richnessPersistence (discontinuity)Environmental monitoringRemote sensingGeographyBiologyComputer scienceGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Airborne environmental DNA (eDNA) has shown promise as a terrestrial biomonitoring tool and its ecological applications are expanding. Despite its growing use, airborne eDNA does not yet have the extensive body of supporting research like its aquatic counterpart, with considerable uncertainty remaining concerning how airborne eDNA behaves, with regards to signal duration, and how much sampling effort is needed to capture DNA in a given airspace. By using airborne eDNA in a semi-controlled environment which acted as an artificial roost where bat species and their abundances were known, we estimated the sampling intensity (both the number of samples and number of sampling events) required to capture bat diversity of a given airspace, as well as signal persistence of airborne eDNA. Together these data provide a temporal scale for airborne eDNA measurements. The majority of species richness was detected using as little as 4 samplers in this enclosed space and the greater the number of sampling events, the fewer samplers were needed. Both air movement and the type of environment (i.e., enclosed space, open area etc.) are likely to impact detection and need to be considered during study design. eDNA also appeared to settle out of the air quickly, suggesting that detections likely reflect recent activity, which also has important implication for rare species which may only have a narrow window for detection. Our results add to the growing body of literature that indicate airborne eDNA can be a useful biosurvey method, especially for rapid surveys in communities with high turnover rates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetEnvironmental DNA in Biodiversity StudiesTravaux en français237 207