Phylogenomics of African Labeo (Cypriniformes: Cyprinidae) emphasizing central African species
Notice bibliographique
Résumé
Labeo constitutes the largest genus within the cyprinid tribe Labeonini with over 110 recognized species in Africa and Asia. The clade comprises a major component of the herbivore/detritivore guild with considerable socio-economic importance to artisanal and commercial fisheries. A pan-African distribution and wide variety of habitat occupancy make the group a model to investigate diversification patterns, eco-phenotypic variation, and biogeographical events underpinning their radiation at a continental scale. However, previous attempts to elucidate Labeo systematics using either molecular or morphological data have failed to produce congruent and robust results, and much taxonomic and nomenclatural confusion remains. Here we present the first phylogenomic analysis of the genus using 2,187 ultraconserved elements from 85 taxa, including 56 recognized species, 27 cryptic (candidate) species, and outgroups from the Asian Labeonini. Both concatenated and coalescence-based phylogenetic analyses strongly support monophyly of African Labeo and recover three major clades comprising at least nine species groups. Two main clades are pan-African, while the third is restricted to four ichthyofaunal provinces. With the single exception of the L. umbratus group, none of the previously proposed morphological groupings are resolved as monophyletic, suggesting rampant morphological convergence across the radiation. In this study, interspecific relationships are well resolved and time calibration results corroborate the key role of the Miocene in the radiation of African freshwater fishes. We identify numerous previously unrecognized taxa, and our study provides a much-needed framework for the taxonomic revision of Labeo, a task critical for the development of sound management of these important food fishes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».