MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4413023049 · doi:10.1039/d5an00741k

Electrochemical and plasmonic detection methods yield comparable analytical performance for DNA hybridization

2025· article· en· W4413023049 sur OpenAlexafffund
Nicolas Fontaine, Miriam Gaida, Philippe Dauphin‐Ducharme

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l'Économie, de la Science et de l'Innovation - QuébecMinistère de l'Économie, de l’Innovation et des Exportations du Québec
Mots-clésBiosensorPlasmonDNANanotechnologyDNA–DNA hybridizationComputational biologyYield (engineering)ElectrochemistryMaterials scienceBiological systemChemistryBiologyOptoelectronicsGeneticsElectrode

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA-based biosensors have been engineered for the measurement of different molecular targets. Depending on the means through which binding is transduced, this may introduce differences in analytical performance, especially when looking at the target's molecular weight and length. To address this question, we developed a combined approach of two commonly used transduction methods in DNA-based biosensors - electrochemistry and surface plasmon resonance - for concomitant surface interrogation. Specifically, we looked at the limits of detection and maximal responses of redox-reporter-modified DNA interfaces of increasing lengths binding to their complementary sequences. In doing so, along with comparable limits of detection, we observed that both methods produced similar sigmoidal target-responses that monotonically varied as a function of sequence length. We envision that our combined electrochemical-surface plasmon resonance (eSPR) approach showcases that SPR could be used as a first method to help engineer recognition elements before purchasing costly redox modifications, and in turn accelerate their translation into sensing platforms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe AnalystMême sujetAdvanced biosensing and bioanalysis techniquesTravaux en français237 207