Derivatization of Solid Supports Using a Carbamate‐Linked Tether Containing a Disulfide Functional Group
Notice bibliographique
Résumé
Chemical modifications of oligonucleotides are widely used to improve their functional properties. Amino modifiers provide versatile chemical handles for post-synthetic (bio)conjugation, nucleic acid immobilization on solid supports, and studies of nonenzymatic genome replication related to the origins of life. This protocol describes an economical disulfide-containing solid-support linker that enables on-column synthesis of nucleic acids bearing 3'-amino or 3'-phosphate modifications. The orthogonal nature of this linker allows for an on-column protecting group strategy, facilitating the synthesis of DNA and RNA containing 3'-amino-2',3'-dideoxyribosides from commercially available unprotected mononucleosides. This protocol further extends the on-column construction of oligomers containing 3'-amino-2',3'-dideoxyribosides to those containing a 2'-amino-2'-deoxynucleoside at the 3'-end, using an orthogonal protecting group strategy. An improved on-column deprotection procedure for DNA and RNA is also presented, eliminating the precipitation step typically utilized in conventional RNA workflows, resulting in an enhanced strand recovery for certain sequences. Finally, the disulfide-containing solid support is applied to the preparation of amino acid-oligonucleotide conjugates, wherein the identity of the final product was contingent upon the specific deprotection conditions employed. All oligonucleotide conjugates and derivatives were purified using standard methods [(e.g., strong anion exchange high-performance liquid chromatography (SAX-HPLC)] and characterized by mass spectrometry (MS). © 2025 The Author(s). Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Synthesis of 4,4'-dimethoxytrityl (DMTr) disulfide succinimide and solid-support functionalization reaction Basic Protocol 2: Solid-phase synthesis of DNA containing a 3'-amino-2',3'-dideoxyguanosine using 3'-Disulfide CPG Alternate Protocol 1: Synthesis of DNA containing terminal 2'-amino-2'-deoxyadenosine Alternate Protocol 2: Alternate RNA (terminated with 3'-amino modifiers or phosphate) workflow using D-TentaGel Basic Protocol 3: Amino acid-oligonucleotide conjugate synthesis using Lys and D-TentaGel.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».