Functional profiles and organochlorine degradation potential in microbial communities of tropical epilithic biofilms: a case study in Guadeloupe (Lesser Antilles)
Notice bibliographique
Résumé
This study investigates the composition, structure, and predictive associated functions of epilithic bacteria living in the biofilms of a freshwater (FWR) and a mixed-saline (MSR) tropical river. High-throughput sequencing revealed a 69% overlap in species richness between the two sites. Cyanobacteria were dominant in freshwater, while heterotrophic classes like Alphaproteobacteria and Betaproteobacteria were prevalent in the mixed-saline biofilm. Predictive functional analysis (FAPROTAX) indicated greater diversity in MSR, favoring organic matter degradation and nutrient cycling, with more bacterial OTUs involved in chemoheterotrophy and hydrogen oxidation (Wilcoxon, p > 0.001). In contrast, FWR had a higher abundance of OTUs linked to phototrophy and degradation of aromatic compounds and plastics (Wilcoxon, p > 0.001). Key microbial interactions were revealed between phototrophic cyanobacteria and heterotrophs such as Fulvivirga (Cytophagia), suggesting a pivotal role for this genus in the carbon cycle. Additionally, bacterial species known for their ability to remove chlorine from pollutants, such as Acidovorax, Acinetobacter, Comamonas, Curvibacter, Sediminibacterium, or bacterial species belonging to the Sphingomonadaceae family were more diverse and abundant in FWR site. These findings point to promising bioremediation potential driven by biofilm community activities, particularly in tropical freshwater environments impacted by organochlorine contaminants.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».