Using MUC2 mucin producing tumorigenic human goblet-like cells to uncover functional properties of the mucus barrier
Notice bibliographique
Résumé
Goblet cells are the guardians that produce MUC2 mucin that forms the protective mucus barrier as the first line of innate host defense against pathogen invasion while sustaining a healthy gut microbiota. Using an unbiased screen, we cloned a high LS174T colonic adenocarcinoma MUC2 mucin-producing goblet-like cell that revealed by whole genome sequencing, mutations that upregulated the expression of tumor suppressor TP53, anterior gradient 2 (AGR2) and mitogen-activated protein kinase kinases (MEK and MAPK) genes that enhanced MUC2 biosynthesis and secretion. Hypersecretory mutant (Mut) cells exhibited a phenotype characterized by high constitutive MUC2 mRNA, upregulation of glycosyltransferases, and hypersecretion of sialylated and fucosylated MUC2 mucus enumerated by glycomics analysis. Mut secreted mucus was altered quantified by increased permeability to fluorescence microsphere (0.2 μm and 1 μm) beads and to Salmonella enterica adherence, invasion, and cell death as compared to WT controls. Shotgun proteomic analysis revealed that Mut cells were upregulated in metabolic pathways for oxidative stress, HIF pathways and growth factors that enhanced wound healing, and tumorigenesis. These results highlight the importance of regulatory genes for proper mucus production in providing barrier function and homeostasis in the gastrointestinal tract that is markedly affected by metabolic stress and glycosylation prevalent in colonic carcinomas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».