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Enregistrement W4413055865 · doi:10.1021/acsinfecdis.5c00268

Rapid Detection of Carbapenemase-Producing Enterobacterales Using a Luminescent Whole-Cell Biosensor

2025· article· en· W4413055865 sur OpenAlexafffund
Mitchell A Jeffs, Shreyas Bhat, Josephine L Liu, Rachel A. V. Gray, Xena X. Li, Prameet M. Sheth, Christopher T. Lohans

Notice bibliographique

RevueACS Infectious Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensKingston Health Sciences CentreToronto General HospitalSunnybrook Health Science CentreHealth Sciences CentreQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiosensorMicrobiologyAntibioticsAntimicrobialBiologyClinical microbiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) pose an urgent global health threat due to their ability to inactivate carbapenems, a group of last-resort antibiotics. Infections caused by these pathogens are associated with poor patient outcomes, high mortality rates, and added burden to infection prevention and control programs, making early detection vital to ensure optimal antimicrobial therapy and appropriate implementation of infection control practices. In this study, we report the application of a luminescent whole-cell biosensor for the rapid detection of CPE. This biosensor provides positive test results within 2.5 h, inclusive of setup time, and has been validated with a panel of laboratory and clinical isolates producing a diverse range of carbapenemases (KPC, NDM, IMP, VIM, and OXA-48-like). The assay identified 81/83 CPE isolates tested with a sensitivity of 97.5%, including strains producing weak OXA-48-like carbapenemases, which are sometimes missed by currently used detection methods. The assay also demonstrated a specificity of 100%, with all non-CPE clinical isolates testing negative under the optimized assay conditions. Due to the rapid time-to-positivity, minimal setup requirements, and high sensitivity, this test could serve as an attractive alternative to CPE detection methods currently employed by clinical microbiology laboratories and could also facilitate CPE screening in other settings ( e.g., environmental and agricultural).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,729

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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