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Enregistrement W4413064174 · doi:10.1101/2025.07.15.664851

Investigation of CD36 interactome provides insights into multimolecular complexes necessary for anti-angiogenic signalling

2025· preprint· en· W4413064174 sur OpenAlexafffund
Arashdeep Saini, Erik Gomez‐Cardona, Han Huang, Swai Mon Khaing, Khuloud Jaqaman, Olivier Julien, Nicolas Touret

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanada Foundation for Innovation
Mots-clésCell biologyProximity ligation assaySignal transductionBiologyTetraspaninCD36InteractomeComputational biologyReceptorBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Signal transduction is a fundamental process that enables cells to adapt to external cues and organize adequate responses including survival, death, growth, and homeostasis. A key mechanism modulating signal transduction relies on the formation of multimolecular complexes optimized for specificity, modularity and signal amplification. The scavenger receptor CD36, which binds diverse ligands in different cellular contexts, illustrates this principle. To uncover the nature of CD36 multimolecular complexes, we employed a proximity biotinylation labeling approach on human endothelial cells, where CD36 binds to thrombospondin-1 (TSP-1) to initiate a signaling cascade promoting programmed cell death. Using biotin capture and mass spectrometry protein identification, we uncovered a list of proteins in the vicinity of CD36. This list of candidates was refined by proximity ligation assays. The relationship between key CD36 interacting molecules, in particular active integrin beta-1 (ITGB1) and CD9, was further decoded by conditional colocalization analysis, providing support for their association within a tri-molecular complex. The implication of selected candidates in the signaling function of CD36 was further evaluated using shRNA knockdown, revealing that active ITGB1 is essential for Fyn activation downstream of CD36, with the tetraspanin playing a connecting role between CD36 and active ITGB1. Our approach to investigating CD36 complexes emphasizes the complexity and fundamental role of protein-protein interactions and coordination in the context of transmembrane signal transduction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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