High mid-treatment tumour RNA disruption in patients with HER2-negative breast cancer is associated with improved disease-free survival after neoadjuvant chemotherapy
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: High tumour ribosomal RNA degradation (RNA disruption) during neoadjuvant chemotherapy has been associated with a post-treatment pathologic complete response (pCR) and improved disease-free survival (DFS) in breast cancer patients. We further assessed the relationship between tumour RNA disruption or other metrics and neoadjuvant chemotherapy outcome using data from the NeoAva clinical trial (NCT00773695). METHODS: Patients with early HER2-negative breast cancer received FEC-T chemotherapy ± bevacizumab in a randomized fashion. Biopsies were taken pre-treatment and after 12 and 25 weeks of chemotherapy. RNA and proteins extracted from the biopsies were used to compute the RNA disruption index (RDI) and to quantify levels of 210 proteins using protein array analysis at 12 weeks. RESULTS: Tumour RDI values were higher mid- and post-treatment than pre-treatment (p < 0.0001). Patients with tumour RDI values > 1.1 exhibited higher disease-free and breast cancer-specific survival than patients with RDI values ≤ 1.1 (p = 0.049 and 0.031, respectively). While RDI values were higher for patients on the bevacizumab-containing regimen (p = 0.003), this was not associated with improved survival. Survival on either regimen was not significantly associated with a post-treatment pCR or an improved residual cancer burden (RCB) score. Significant differences in apoptotic, EMT, Notch, G1-S checkpoint, and DNA damage response pathways were seen between high- and low-RDI tumours. CONCLUSIONS: High tumour RNA disruption during neoadjuvant chemotherapy was associated with improved DFS and may better predict outcome than the post-treatment pCR rate or RCB. If validated as an independent predictor of chemotherapy outcome, RNA disruption assessments during treatment may prove informative in making treatment escalation or de-escalation decisions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».