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Enregistrement W4413107263 · doi:10.1080/07366205.2025.2536438

Optimizing chromosome yield: a comparative analysis of harvesting, preparation and waste recovery methods

2025· article· en· W4413107263 sur OpenAlexaff
Rinyaporn Phengchat, Stanley W. Botchway, Mohammed Yusuf

Notice bibliographique

RevueBioTechniques · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensNational Research Council CanadaNational Institute for Nanotechnology
Organismes subventionnairesCentral Laser Facility, Science and Technology Facilities CouncilScience and Technology Facilities Council
Mots-clésColcemidNocodazoleMitosisChromosomeBiologyMolecular biologyTrypsinizationGeneticsCellBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mitotic chromosome preparation, it is crucial to maximize chromosome yield for downstream cytogenetic analysis. Using HeLa cells as a model adherent cell, we assessed and compared the recovery of chromosomes from the entire process as well as the fraction of chromosomes that would generally become discarded in the standardly used trypsinization and mitotic-shake-off chromosome preparation methods. A higher chromosome yield for polyamine (PA) and methanol acetic acid (MAA) chromosomes was achieved using the mitotic-shake-off method compared to trypsinization. Moreover, mitotic arrest using colcemid or nocodazole gave similar PA and MAA chromosome yields in the commonly collected fractions. Interestingly, when comparing the fractions that would usually be discarded in the mitotic-shake-off, for colcemid-treated cells compared to nocodazole-treated cells, a greater number of PA chromosomes was recovered from the former. Our results show that chromosomes can be retrieved from the waste media. These recovered chromosomes display a suitable morphology in all chromosome preparations, suggesting that in conditions where high chromosome yields are required, utilizing the mitotic-shake-off method and recovering the generally discarded chromosome fraction together with the commonly used fraction would aid in maximizing chromosome yield.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,148

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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