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Enregistrement W4413112001 · doi:10.1002/ajmg.a.64214

Generating Advancements in Longitudinal Analysis in X and Y Variations: Rationale, Methods, and Diagnostic Characteristics for the <scp>GALAXY</scp> Registry

2025· article· en· W4413112001 sur OpenAlexaff
Alexandra Carl, Samantha Bothwell, Karli Swenson, Ryan Bregante, Lilian Cohen, Virginia Cover, Anna Dawczyk, Gail Decker, Stephen B. Gerken, David S. Hong, Susan Howell, Armin Raznahan, Alan D. Rogol, Nicole Tartaglia, Shanlee Davis

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational Sciences
Mots-clésGalaxyLongitudinal dataAstrophysicsMedicineComputational biologyPsychologyComputer sciencePhysicsBiologyData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sex chromosome aneuploidies (SCAs) are a family of genetic disorders that result from an atypical number of X and/or Y chromosomes. SCAs are the most common chromosomal abnormality, affecting ~1/400 live births, yet are often underdiagnosed, leading to over-representation of more severely impacted individuals in many clinical studies. In addition to this ascertainment bias, existing work in SCAs has also been limited by low geographic and demographic diversity. To address these limitations, we have created the Generating Advancements with Longitudinal Analysis in X and Y variations (GALAXY) Registry. Through prioritizing sustainability, transparency, and minimizing participant burden, the overarching goal of the GALAXY Registry is to improve health outcomes for individuals with SCAs by serving as an infrastructure for future SCA research based on a large, heterogeneous, and longitudinal sample. To date, GALAXY has accrued 335 verified SCA participants with an average accrual of 11.2 participants/month (6.7 47,XXY, 1.9 47,XXX, 2.0 47,XYY, 3.2 48,XXYY, 1.8 48,XXXY, and 1.3 Other). Demographic data between those identified to have SCA prenatally (predominantly cell-free DNA screening) differ from those diagnosed postnatally for insurance status, age at enrollment, genetic test type, and reason for SCA diagnosis. Next steps include targeted recruitment of underrepresented groups (e.g., non-47,XXY karyotypes, older adults, minoritized individuals), extraction of medical record data into the registry, international expansion, and continued engagement with the SCA community. As a collaboration between clinician investigators and the SCA community, the GALAXY Registry is a powerful resource for future patient-centered clinical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,232
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,347
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,232
Score d'incertitude au seuil0,947

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2320,347
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0060,011
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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